MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025 plasmid pRSPA02

Total Repeats: 7172

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009430	CGGC	2	8	84	91	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_009430	GC	4	8	117	124	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_009430	ATA	2	6	151	156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	146279974
4	NC_009430	GCC	2	6	179	184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279974
5	NC_009430	GCG	2	6	224	229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279974
6	NC_009430	CGGG	2	8	230	237	0 %	0 %	75 %	25 %	146279974
7	NC_009430	GAA	2	6	240	245	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279974
8	NC_009430	GGC	2	6	246	251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279974
9	NC_009430	CGA	2	6	311	316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279974
10	NC_009430	CTC	2	6	412	417	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146279974
11	NC_009430	CG	3	6	471	476	0 %	0 %	50 %	50 %	146279974
12	NC_009430	CCGAT	2	10	488	497	20 %	20 %	20 %	40 %	146279974
13	NC_009430	GCA	2	6	504	509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279974
14	NC_009430	GCC	2	6	519	524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_009430	TGC	2	6	623	628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279975
16	NC_009430	GGT	2	6	640	645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279975
17	NC_009430	GGGC	2	8	676	683	0 %	0 %	75 %	25 %	146279975
18	NC_009430	GCC	2	6	715	720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279975
19	NC_009430	AGC	2	6	792	797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279975
20	NC_009430	CCA	2	6	817	822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279975
21	NC_009430	GGA	2	6	838	843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279975
22	NC_009430	GCC	2	6	879	884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279975
23	NC_009430	CCG	2	6	918	923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279975
24	NC_009430	CAC	2	6	940	945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279975
25	NC_009430	GGC	2	6	985	990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279975
26	NC_009430	GGCG	2	8	1057	1064	0 %	0 %	75 %	25 %	146279975
27	NC_009430	AGG	2	6	1095	1100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279975
28	NC_009430	GCCA	2	8	1104	1111	25 %	0 %	25 %	50 %	146279975
29	NC_009430	GAC	2	6	1115	1120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279975
30	NC_009430	CCT	3	9	1129	1137	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146279975
31	NC_009430	G	7	7	1159	1165	0 %	0 %	100 %	0 %	146279975
32	NC_009430	TCG	2	6	1205	1210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279975
33	NC_009430	AGC	2	6	1338	1343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279976
34	NC_009430	CAG	2	6	1349	1354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279976
35	NC_009430	AGG	2	6	1362	1367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279976
36	NC_009430	GACC	2	8	1400	1407	25 %	0 %	25 %	50 %	146279976
37	NC_009430	CG	4	8	1469	1476	0 %	0 %	50 %	50 %	146279976
38	NC_009430	CCGGA	2	10	1481	1490	20 %	0 %	40 %	40 %	146279976
39	NC_009430	GGGGT	2	10	1640	1649	0 %	20 %	80 %	0 %	146279977
40	NC_009430	CGA	2	6	1697	1702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279977
41	NC_009430	GC	6	12	1703	1714	0 %	0 %	50 %	50 %	146279977
42	NC_009430	CCG	2	6	1728	1733	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279977
43	NC_009430	GGC	2	6	1799	1804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279977
44	NC_009430	AAG	2	6	1836	1841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279977
45	NC_009430	CG	3	6	1844	1849	0 %	0 %	50 %	50 %	146279977
46	NC_009430	GCC	2	6	1854	1859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279977
47	NC_009430	CCCG	2	8	1864	1871	0 %	0 %	25 %	75 %	146279977
48	NC_009430	CAG	3	9	1886	1894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279977
49	NC_009430	CCA	2	6	1928	1933	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279977
50	NC_009430	GAC	2	6	1949	1954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279977
51	NC_009430	GCC	2	6	1956	1961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279977
52	NC_009430	ACG	2	6	1977	1982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279977
53	NC_009430	CCGG	2	8	2014	2021	0 %	0 %	50 %	50 %	146279977
54	NC_009430	GAA	2	6	2063	2068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279977
55	NC_009430	GCC	2	6	2078	2083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279977
56	NC_009430	GCA	2	6	2162	2167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279977
57	NC_009430	TTC	2	6	2235	2240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	146279977
58	NC_009430	GCA	2	6	2275	2280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279977
59	NC_009430	CGA	2	6	2347	2352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279977
60	NC_009430	CG	4	8	2369	2376	0 %	0 %	50 %	50 %	146279977
61	NC_009430	AGA	2	6	2422	2427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279977
62	NC_009430	GAA	2	6	2438	2443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279977
63	NC_009430	GA	3	6	2444	2449	50 %	0 %	50 %	0 %	146279977
64	NC_009430	CGGC	2	8	2528	2535	0 %	0 %	50 %	50 %	146279977
65	NC_009430	CAG	3	9	2540	2548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279977
66	NC_009430	CCA	2	6	2584	2589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279977
67	NC_009430	CCA	2	6	2608	2613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279977
68	NC_009430	GCC	2	6	2637	2642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279977
69	NC_009430	CG	3	6	2656	2661	0 %	0 %	50 %	50 %	146279977
70	NC_009430	GCCC	2	8	2667	2674	0 %	0 %	25 %	75 %	146279977
71	NC_009430	CAG	2	6	2696	2701	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279977
72	NC_009430	CAG	2	6	2711	2716	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279977
73	NC_009430	GCC	2	6	2775	2780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279977
74	NC_009430	GCG	2	6	2883	2888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279977
75	NC_009430	GGT	2	6	2893	2898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279977
76	NC_009430	CGT	2	6	2908	2913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279977
77	NC_009430	AGC	3	9	2952	2960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279977
78	NC_009430	CCGC	2	8	2961	2968	0 %	0 %	25 %	75 %	146279977
79	NC_009430	GCC	2	6	2973	2978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279977
80	NC_009430	GCGCCC	2	12	2980	2991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279977
81	NC_009430	AGG	2	6	3003	3008	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279977
82	NC_009430	AAG	2	6	3044	3049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279977
83	NC_009430	GC	3	6	3052	3057	0 %	0 %	50 %	50 %	146279977
84	NC_009430	GCA	2	6	3070	3075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279977
85	NC_009430	CAG	2	6	3098	3103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279977
86	NC_009430	GGC	2	6	3104	3109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279977
87	NC_009430	TCA	2	6	3160	3165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279977
88	NC_009430	CGC	2	6	3197	3202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279977
89	NC_009430	GAT	2	6	3280	3285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279978
90	NC_009430	ATG	2	6	3290	3295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279978
91	NC_009430	CGG	2	6	3329	3334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279978
92	NC_009430	CG	3	6	3335	3340	0 %	0 %	50 %	50 %	146279978
93	NC_009430	CG	3	6	3343	3348	0 %	0 %	50 %	50 %	146279978
94	NC_009430	CCT	2	6	3366	3371	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	146279978
95	NC_009430	CGGG	2	8	3389	3396	0 %	0 %	75 %	25 %	146279978
96	NC_009430	GAG	2	6	3566	3571	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	146279978
97	NC_009430	CCA	2	6	3576	3581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	146279978
98	NC_009430	GCCCC	2	10	3586	3595	0 %	0 %	20 %	80 %	146279978
99	NC_009430	GCC	3	9	3671	3679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279978
100	NC_009430	GCC	2	6	3695	3700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279978
101	NC_009430	GC	3	6	3702	3707	0 %	0 %	50 %	50 %	146279978
102	NC_009430	GGGC	2	8	3744	3751	0 %	0 %	75 %	25 %	146279978
103	NC_009430	GGC	2	6	3775	3780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279978
104	NC_009430	CGG	2	6	3842	3847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279978
105	NC_009430	CGC	2	6	3874	3879	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279978
106	NC_009430	CGG	2	6	3900	3905	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279978
107	NC_009430	GGC	2	6	3909	3914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279978
108	NC_009430	GC	3	6	3995	4000	0 %	0 %	50 %	50 %	146279979
109	NC_009430	GCCCC	2	10	4019	4028	0 %	0 %	20 %	80 %	146279979
110	NC_009430	GGC	2	6	4068	4073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279979
111	NC_009430	GCC	2	6	4119	4124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279979
112	NC_009430	GCG	2	6	4170	4175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279979
113	NC_009430	GC	3	6	4238	4243	0 %	0 %	50 %	50 %	146279979
114	NC_009430	GCCCGC	2	12	4272	4283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279979
115	NC_009430	CG	4	8	4316	4323	0 %	0 %	50 %	50 %	146279979
116	NC_009430	GC	4	8	4448	4455	0 %	0 %	50 %	50 %	146279979
117	NC_009430	CGG	2	6	4515	4520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279979
118	NC_009430	TGCGGC	2	12	4538	4549	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	146279979
119	NC_009430	GC	3	6	4548	4553	0 %	0 %	50 %	50 %	146279979
120	NC_009430	CG	3	6	4577	4582	0 %	0 %	50 %	50 %	146279979
121	NC_009430	AGCG	2	8	4624	4631	25 %	0 %	50 %	25 %	146279979
122	NC_009430	GCC	2	6	4639	4644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279979
123	NC_009430	GGCCT	2	10	4687	4696	0 %	20 %	40 %	40 %	146279979
124	NC_009430	GCC	2	6	4729	4734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279979
125	NC_009430	CG	3	6	4788	4793	0 %	0 %	50 %	50 %	146279979
126	NC_009430	GAT	2	6	4797	4802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279979
127	NC_009430	CGC	2	6	4853	4858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279979
128	NC_009430	CGG	2	6	4867	4872	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279979
129	NC_009430	GGT	3	9	4934	4942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	146279979
130	NC_009430	CGG	2	6	4958	4963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279979
131	NC_009430	CCG	2	6	4972	4977	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279979
132	NC_009430	CG	3	6	5021	5026	0 %	0 %	50 %	50 %	146279979
133	NC_009430	ATC	2	6	5104	5109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279979
134	NC_009430	GGC	2	6	5127	5132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279979
135	NC_009430	GGC	2	6	5141	5146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279979
136	NC_009430	GCCC	2	8	5167	5174	0 %	0 %	25 %	75 %	146279979
137	NC_009430	GCCG	2	8	5193	5200	0 %	0 %	50 %	50 %	146279979
138	NC_009430	C	6	6	5225	5230	0 %	0 %	0 %	100 %	146279979
139	NC_009430	GCG	2	6	5231	5236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279979
140	NC_009430	GCCG	2	8	5321	5328	0 %	0 %	50 %	50 %	146279980
141	NC_009430	TCG	2	6	5406	5411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279980
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145	NC_009430	ATC	2	6	5496	5501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	146279980
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155	NC_009430	GCCC	2	8	5838	5845	0 %	0 %	25 %	75 %	146279980
156	NC_009430	GCCG	2	8	5846	5853	0 %	0 %	50 %	50 %	146279980
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159	NC_009430	CCGGG	2	10	5973	5982	0 %	0 %	60 %	40 %	146279980
160	NC_009430	CCG	2	6	5986	5991	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279980
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169	NC_009430	CGA	2	6	6166	6171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279980
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172	NC_009430	GCC	2	6	6242	6247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279980
173	NC_009430	GCA	2	6	6250	6255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279980
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211	NC_009430	C	7	7	7455	7461	0 %	0 %	0 %	100 %	146279982
212	NC_009430	CGG	2	6	7494	7499	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279982
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214	NC_009430	GATC	2	8	7531	7538	25 %	25 %	25 %	25 %	146279982
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250	NC_009430	GCG	2	6	8509	8514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
251	NC_009430	CG	3	6	8513	8518	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
252	NC_009430	GCC	2	6	8554	8559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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263	NC_009430	CGC	2	6	8893	8898	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279983
264	NC_009430	AAG	2	6	8913	8918	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279983
265	NC_009430	CGA	2	6	8927	8932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279983
266	NC_009430	AGA	2	6	8953	8958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	146279983
267	NC_009430	ATGGGC	2	12	8962	8973	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	146279983
268	NC_009430	TCC	2	6	8974	8979	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
269	NC_009430	CGG	2	6	9056	9061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
270	NC_009430	CGG	2	6	9082	9087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
271	NC_009430	CGG	2	6	9142	9147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279984
272	NC_009430	GCGG	3	12	9144	9155	0 %	0 %	75 %	25 %	146279984
273	NC_009430	GGC	2	6	9156	9161	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279984
274	NC_009430	CGTCC	2	10	9174	9183	0 %	20 %	20 %	60 %	146279984
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279	NC_009430	TCG	2	6	9333	9338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	146279984
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282	NC_009430	GA	3	6	9426	9431	50 %	0 %	50 %	0 %	146279984
283	NC_009430	CGGCC	2	10	9455	9464	0 %	0 %	40 %	60 %	146279984
284	NC_009430	TCC	2	6	9528	9533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
285	NC_009430	ACGGGC	2	12	9538	9549	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
286	NC_009430	CGG	2	6	9553	9558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_009430	GCG	2	6	9560	9565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_009430	CTC	2	6	9591	9596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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290	NC_009430	CCG	2	6	9619	9624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
291	NC_009430	CTC	2	6	9645	9650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
292	NC_009430	GCC	2	6	9693	9698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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298	NC_009430	CGG	2	6	9830	9835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279985
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394	NC_009430	CCG	2	6	13246	13251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279990
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402	NC_009430	GGGC	2	8	13512	13519	0 %	0 %	75 %	25 %	146279990
403	NC_009430	CGG	2	6	13531	13536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279990
404	NC_009430	TCCGGC	2	12	13581	13592	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	146279990
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489	NC_009430	CGCC	2	8	17416	17423	0 %	0 %	25 %	75 %	146279994
490	NC_009430	GACC	2	8	17425	17432	25 %	0 %	25 %	50 %	146279994
491	NC_009430	GAT	2	6	17440	17445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	146279994
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493	NC_009430	CCG	2	6	17552	17557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279994
494	NC_009430	GC	3	6	17566	17571	0 %	0 %	50 %	50 %	146279994
495	NC_009430	GCA	2	6	17602	17607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	146279994
496	NC_009430	C	6	6	17623	17628	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
497	NC_009430	GCGCG	2	10	17640	17649	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
498	NC_009430	CCG	2	6	17661	17666	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
499	NC_009430	GCC	2	6	17706	17711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	146279995
500	NC_009430	CGG	2	6	17730	17735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	146279995

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